При эпистазе генотип может полностью подавлять фенотип другого гена, потому что аллель одного гена подавляет проявление аллеля из другой аллеломорфной пары — неаллельного гена. 13

Это происходит благодаря синтезу регуляторных белков на основе регуляторного гена: 2

1. В первом случае регуляторный ген активен и синтезирует белок-репрессор, препятствующий транскрипции основного структурного гена, определяющего признак. 2
2. Во втором случае регуляторный ген не способен синтезировать белок-активатор, который будет регулировать активность структурного гена. 2 По сути, регуляторный ген нарушен. 2

В обоих случаях не синтезируется белок, отвечающий за признак. 2