Предлог «в» с существительным «наличие» является устойчивым выражением, потому что зачастую требует после себя предложного падежа, в котором у слова «наличие» окончание «и». 1

Так как предлог «в» выражает зависимость одного слова от другого, он требует после себя предложного падежа, что обосновывает употребление окончания «и» на конце слова. 3