Правила пунктуации в русском языке иногда противоречат логике построения предложения, потому что они более гибкие, чем может показаться на первый взгляд. 1

Это следует из смыслового принципа пунктуации, который учитывает смысловые оттенки речи, поскольку от разного осмысления высказывания зависит вариативность постановки знаков препинания. 2 Например, в зависимости от понимания предложения возможны разные знаки при перечислении. 1

Также знаки препинания не всегда соотносятся с паузами. 1 Основной принцип русской пунктуации — синтаксический (формально-грамматический): знаки отражают прежде всего структуру предложения, а интонацию — не всегда. 1

Таким образом, правила пунктуации работают по структурно-смысловой схеме с учётом функций каждого сегмента высказывания. 4