Несколько причин, по которым за последнее десятилетие резко сократилась популяция тугуна:

• Загрязнение водоёмов. 13 Это приводит к ухудшению условий обитания рыбы. 2
• Бесконтрольный вылов. 13 В том числе на путях к местам нереста и в самих нерестилищах. 3
• Строительство ГЭС. 1 Оно приводит к искусственной смене направления русел рек, что также влияет на миграцию тугуна. 1
• Изменение условий в реке Собь. 5 С середины 80-х годов численность тугуна в ней резко сократилась из-за добычи гравия, что привело к уничтожению нерестилищ, ухудшению условий нагула и зимовки. 5