Популяция северного оленя в Саяно-Шушенском заповеднике небольшая (около 30 особей) по нескольким причинам:

• Изоляция. 14 Группировка живёт обособленно, у оленей нет возможности мигрировать и скрещиваться с другими северными оленями из-за водохранилища. 14
• Близкородственное скрещивание. 2 Замкнутый мир заповедника увеличивает риск близкородственного скрещивания, что может плохо сказаться на популяции. 1
• Браконьерство. 3 В 90-е годы численность оленей подорвали из-за распространённого браконьерства с вертолётов. 3
• Климатические изменения. 3 Лесной олень чутко реагирует на изменения климата, не переносит кровососущих насекомых, которых становится всё больше из-за потепления. 3
• Конкуренция с домашним оленем. 3 У этих животных одни и те же пастбища. 3