Несколько причин, по которым подземная среда обитания может иметь ограниченное разнообразие организмов:

• Высокая температура. 1 На глубинах она может достигать 120 °C, что повреждает ДНК и аминокислоты. 1
• Повышенное давление. 1 Глубинная биосфера выдерживает давление, намного превышающее давление на поверхности Земли. 1
• Скудность питательных веществ. 1 Чем глубже находятся морские отложения, тем ниже в них содержание органических веществ. 1

Однако, по данным исследования Морской биологической лаборатории (MBL, США), в некоторых подземных средах разнообразие микробов может соперничать, а в некоторых случаях даже превышать разнообразие, наблюдаемое на поверхности. 5 Это связано с тем, что многие микробы, обитающие под землёй, адаптировались к условиям, где доступная энергия значительно ниже, чем на поверхности. 5