Пифагорейский и чистый строи не используются в современной музыке по нескольким причинам:

• Несовершенство пифагорейского строя. 3 При настройке инструмента этим строем неизбежно появлялась «волчья» квинта — соотношение звуков, которое меньше квинты на одну пифагорову комму. 3 Это основная причина, по которой пифагорейский строй практически не используется. 3
• Сложности с модуляциями. 25 В пифагоровом строе невозможно модулировать в широких пределах, что приводит к какофонии. 2
• Ограничения чистого строя. 5 Музыкант при использовании чистого строя был фактически «привязан» к одной тональности. 45 Модуляции и отклонения в другие, даже ближайшие, тональности становились невозможны, так как в них инструмент оказывался «настроен не идеально». 45

В современной музыке используется равномерно темперированный строй, который позволяет легко совершать переход из тональности в тональность и транспонировать музыкальные произведения. 14