Пептидные связи в белках преимущественно находятся в транс-конфигурации, потому что транс-изомер энергетически более выгоден, чем цис-изомер. 2

Такое свойство пептидной связи делает невозможным свободное вращение заместителей вокруг неё, поэтому пептидная группировка является плоской и обычно имеет транс-конфигурацию. 1