Причины вымирания парацератерия неизвестны, но есть несколько теорий, которые объясняют исчезновение этого животного. 4

Одна из версий — смена климата. 35 В конце олигоцена (около 23 млн лет назад) климат стал суше, леса сменились степями, а реки мелели. 3 Для парацератерия, которому требовалось до 500 кг пищи в день, учитывая его габариты, это стало катастрофой. 3

Ещё одна теория — появление новых травоядных. 3 В тот же период в Азии появились предки оленей и антилоп. 3 Они были меньше, быстрее размножались и эффективнее питались скудной растительностью. 3

Также есть мнение, что парацератериев вытеснили гомфотерии — древние млекопитающие, похожие на слонов с двумя парами бивней. 12

Кроме того, хищники могли сыграть роль в вымирании парацератериев: нападая на детёнышей, они снижали и без того медленные темпы восстановления популяции. 3