Палиндромные последовательности ДНК важны для функционирования клетки, потому что выполняют следующие функции: 12

• Участвуют в обеспечении процессов терминации транскрипции гена (окончание синтеза белка). 1
• Являются местами связывания регуляторных белков, например, репрессоров. 12
• Играют роль в формировании некоторых типов нуклеиновых кислот, например, в случае транспортных РНК. 1 Эти участки образуют петли (в том числе центральную) тРНК. 1
• Способствуют появлению генов микроРНК. 3 Поскольку ДНК используется в качестве шаблона для синтеза матричных РНК, то палиндромы приводят к возникновению в РНК структур в виде шпилек, играющих важное регуляторное значение. 3