Некоторые аминокислоты могут препятствовать образованию α-спиралей в белковых молекулах по следующим причинам:

• Взаимное отталкивание одноименно заряженных аминокислотных остатков. 15 Если в цепи подряд расположено несколько положительно или отрицательно заряженных аминокислотных остатков, такой участок не примет α-спиральной структуры из-за взаимного отталкивания. 1
• Большие размеры радикалов аминокислотных остатков. 1 Затрудняют образование α-спирали радикалы аминокислотных остатков, имеющих большие размеры. 1
• Наличие в полипептидной цепи остатков пролина. 1 В остатке пролина при атоме азота, образующем пептидную связь с другой аминокислотой, нет атома водорода. 1 Поэтому остаток пролина, входящий в состав полипептидной цепи, не способен образовывать внутрицепочечную водородную связь. 1 Кроме того, атом азота в пролине входит в состав жёсткого кольца, что делает невозможным вращение вокруг связи N–C и образование спирали. 1