Онтогенез считается целостным и эквифинальным процессом, потому что для него справедливо правило: целое точнее частей, а конечный результат онтогенеза точнее его промежуточных стадий. 2

Целостность процесса обусловлена тем, что он происходит в результате самоорганизации: согласованные действия множества одинаково запрограммированных клеток создают сложные многоклеточные структуры. 1 При этом действия одних клеток эмбриона (их деление, рост, выделяемые вещества) меняют среду для других клеток эмбриона и влияют на их поведение. 1 В результате поведение клеток оказывается согласованным, а эмбрион начинает вести себя «как целое». 1

Эквифинальность процесса связана с тем, что в нём есть отрицательные обратные связи и специальные стабилизирующие механизмы. 1 Они позволяют онтогенезу компенсировать разные непредвиденные помехи и приходить, невзирая на них, к более или менее «нормальному» итоговому фенотипу. 1