Почему одни ноты сочетаются с другими, а другие - нет? Это что-то глубинно-нейрофизиологическое, или культурно-обусловленное?

Сочетание нот зависит от их характеристик и математического соотношения частот. music.stackexchange.com

Созвучными обычно являются ноты, имеющие одинаковую высоту тона. go.zvuk.com Например, нота фа малой октавы на фортепиано гармонично звучит с нотой фа на гитаре. go.zvuk.com Происходит это потому, что исходящие от нот звуковые волны заставляют вибрировать одни и те же волосковые клетки внутреннего уха. go.zvuk.com

Консонансными считаются определённые интервалы (расстояние между нотами): октава, квинта, кварта и терция. go.zvuk.com Например, хорошо звучат вместе до и соль — расстояние между ними как раз квинта. go.zvuk.com Объяснение кроется в гармониках этих нот, то есть в их дополнительных тонах, по частоте более высоких, чем основной тон. go.zvuk.com Гармоники до и соль (так же, как до и фа) часто совпадают, отсюда и появляется созвучие. go.zvuk.com

Оценка созвучия как консонантного во многом зависит от культуры, характера и даже настроения. go.zvuk.com Строение ушей и мозга отличается, потому отличаются и понятия о «хорошем звуке». habr.com

Таким образом, сочетание нот имеет как нейрофизиологические, так и культурно-обусловленные аспекты.