Нельзя однозначно сказать, почему непрямой органогенез эффективнее прямого при размножении растений, так как выбор между этими процессами зависит от типа используемого эксплантата и целей процесса культуры ткани. 4
Прямой органогенез позволяет получить посадочный материал без генетических вариаций, который гарантированно будет однородным. 2 Этот метод полезен для выращивания растений, которые размножаются быстрее, так как количество растений на эксплант выше. 2
Непрямой органогенез в большей степени способствует развитию трансгенных растений. 2 С помощью этого метода можно создать новое трансгенное растение с использованием трансформированного каллуса. 2
На процесс органогенеза влияют различные факторы, в том числе генотип растения, регуляторы роста растений, физические факторы и состав культуральной среды. 4