Происхождение вирусов неясно, и существует несколько гипотез, объясняющих, как некоторые вирусы могли произойти от плазмид и бактерий. 25

Одна из гипотез предполагает, что вирусы могли появиться из фрагментов ДНК или РНК, которые «высвободились» из генома более крупного организма. 12 Такие фрагменты могли происходить от плазмид — небольших молекул ДНК, способных передаваться от одной клетки к другой. 25

Другая гипотеза гласит, что вирусы «эволюционировали» из бактерий путём естественного отбора. 3 В этом процессе, когда бактерии становятся паразитами, они теряют все сложные белковые структуры, необходимые бактериям. 3

Некоторые учёные предполагают, что произошёл обратный симбиоз: вирусы возникли из частей клеток, таких как бактериальные плазмиды и другие органеллы, и в конечном итоге эволюционировали в отдельные формы жизни. 3

Достоверных доказательств для каждой из этих теорий нет, и на сегодняшний день чёткого объяснения происхождения вирусов не существует. 3