Несколько причин, по которым некоторые виды пещерных рыб могут терять глаза в процессе эволюции:

• Экономия энергии. 2 В пещерах, где обитают эти рыбы, сложно найти пищу, поэтому животным необходимо сохранять энергию. 2 Отсутствие глаз позволяет тратить на 15% меньше энергии, так как для поддержания глаз и зрительных отделов мозга требуется много энергии. 2
• Эпигенетические изменения. 13 Гены, отвечающие за развитие глаз, «выключаются» из-за метилирования ДНК — модификации молекулы ДНК, которая не затрагивает нуклеотидную последовательность. 1 Это происходит как эволюционный ответ на долгие годы жизни в пещерах без света. 1
• Физиологический стресс. 5 При переносе рыб в пещерные воды с низкой проводимостью они испытывают стресс, в результате которого проявляется накопленная скрытая генетическая изменчивость. 5 Из получившихся разнообразных форм преимущество получают мелкоглазые или незрячие формы, так как они более приспособленные, чем их зрячие сородичи. 5 В ходе отбора в новой обстановке генетическое разнообразие снижается, остаются только мелкоглазые формы. 5