Некоторые виды организмов способны к неотении по следующим причинам:

• Генетические мутации и сбои в работе эндокринной системы. 4 Например, у земноводных неотеническая задержка метаморфоза связана с пониженной секрецией щитовидной железы. 2 Если активность железы ослаблена, то и метаморфоз не происходит. 4
• Экологические факторы. 1 Неотения позволяет выживать и размножаться при неблагоприятных для взрослой стадии внешних условиях. 2 Например, в прохладном и засушливом климате горных местностей, тогда как в более тёплом и влажном климате низменных районов преобладают нормально развивающиеся животные. 2
• Увеличение набора ресурсов внешней среды. 2 Способность к неотении увеличивает набор ресурсов, которые могут быть использованы размножающимися особями данного вида. 2