Некоторые виды мышей включены в Красную книгу МСОП по разным причинам, например:

• Африканская водяная мышь. 2 Учёные опасаются, что вид находится на грани исчезновения, так как в местах его обитания пасётся скот, и водяная мышь из этих мест исчезла. 2
• Краснобрюхая жёсткошёрстная мышь. 2 Вид признан уязвимым из-за того, что в местах его обитания стало меньше пищи, а мышь весьма прожорлива. 2

Также в Красную книгу МСОП включены два узкоареальных вида мышей, для ряда из которых точные данные о численности отсутствуют. 1

Решение о включении вида в Красную книгу принимается на основе экспертных оценок состояния популяции и других факторов, которые указывают на угрозу исчезновения. 34