Некоторые причины, по которым словарные слова пишутся именно так, а не иначе:

• Исторический принцип. 4 Слова пишутся так, как исторически сложились правила их написания. 3
• Заимствование из других языков. 45 Заимствованные слова пишутся в соответствии с законами тех языков. 3 Например, написание слова «гитара» объясняется тем, что оно заимствовано в XVIII веке из польского языка, а «километр» произошло от французского kilometre. 5
• Упрощение написания заимствованного слова. 5 Например, написание слова «футбол» объясняется происхождением от английского football, но в английском языке оно имело удвоенную согласную, которая в русской записи исчезла. 5

Чтобы объяснить написание словарных слов, можно обратиться к их происхождению — этимологии. 15