Некоторые причины, по которым некоторые слова остаются непроверяемыми даже после множества веков существования языка:

• Исконно русские слова, пришедшие в современный язык из древнерусского. 2 В древнерусском языке их написание объяснялось языковыми особенностями, но в современный литературный язык эти особенности не перешли, оставив после себя «память» в виде слов, правописание которых нынешними нормами не объяснишь. 2
• Заимствования из других языков. 23 Часть из них пришла в русский язык в таком виде, в каком мы их знаем, часть со временем изменилась, но в любом случае эти слова не подчиняются привычным правилам правописания. 2

Правописание таких слов определяется не на основе существующих языковых правил и закономерностей, а на основании исторически сложившихся традиций и этимологии, закреплённых в орфографическом словаре. 2