Почему некоторые слова на букву Ш имеют странное написание и произношение?

Написание и произношение слов с буквой «ш» может иметь странные особенности по нескольким причинам:

• Неоднозначность соотношения фонемы и буквы. 1 Иногда одной фонеме соответствует более чем одно буквенное обозначение. 1 Например, фонема «ш’» передаётся на письме буквой «щ» и буквосочетанием «сч»: чаща, счастье. 1
• Путаница со «смягчением» звука «ш». 3 Иногда кажется, что звук «ш» может смягчаться, если после буквы «ш» следуют буквы «и», «я», «е», «ю». 3 Но на самом деле звук «ш» в таких словах остаётся твёрдым. 3 Это связано с тем, что согласно правилам орфографии, сочетания «ши», «шю» пишутся с буквой «и», независимо от произношения. 3
• Чередование букв «ш» и «ч». 4 Это характерная особенность старомосковского произношения. 4 Например, в словах «булочная» — «булошная», «молочный» — «молошный». 4

Также существует сигматизм шипящих — недостаток произношения шипящих звуков, в том числе «ш». 5 Он может возникать из-за сенсомоторных нарушений, нарушения иннервации артикуляционных органов, зубо-челюстных аномалий и других факторов. 5