Наличие или отсутствие клеточной оболочки у простейших связано с особенностями их строения и образа жизни.

Простейшие, у которых нет плотной клеточной стенки, вынуждены жить во влажных средах: воде, почве или других организмах. 2 Такая среда оберегает их от вредоносных солнечных лучей и испарения воды. 2

У некоторых простейших, например жгутиконосцев и инфузорий, есть уплотнённый наружный слой цитоплазмы — пелликулу. 25 Она выполняет функцию поддержания формы клетки. 2

Также многие простейшие при неблагоприятных условиях образуют защитную оболочку — цисту. 23 В таком состоянии они могут находиться долгое время, а при благоприятных условиях простейшее освобождается от оболочки и начинает вести подвижный образ жизни. 3