Некоторые плауновидные и хвощевидные виды считаются вымирающими из-за изменения климата, в частности похолодания и снижения влажности. 13

В прошлом, в конце каменноугольного периода, многие споровые растения, к которым относятся хвощи, плауны и папоротники, вымерли из-за того, что климат стал менее благоприятным для их размножения. 2 На смену им пришли голосеменные представители флоры, которым для размножения не нужна вода. 2

Кроме того, на вымирание плауновидных растений влияют утрата естественных местообитаний из-за человеческой деятельности и антропогенные воздействия на экосистемы. 4