Несколько причин, по которым некоторые организмы сохраняются в виде окаменелостей, а другие нет:

• Твёрдые части организмов. 14 Костям, зубам, хитиновым панцирям, раковинам необходимо более длительное время для разложения, чем мягким частям тела, например, внутренним органам. 4
• Скорость захоронения. 5 Чем быстрее тело попадает под землю, тем выше шанс сохранить его нетронутым. 5
• Наличие воды. 5 Если тело оказалось в засушливой среде, то со временем оно обратится в прах и смешается с окружающей почвой. 5
• Анаэробная среда. 1 В мелкозернистом иле на дне озёр и морей, где очень мало кислорода, бактерии замедляют химические реакции разложения и способствуют образованию окаменелостей. 1

Организмы, не имеющие твёрдых минерализованных частей, редко образуют окаменелости. 1 Например, в летопись окаменелостей не попадают почти все одноклеточные существа и другие микроорганизмы (бактерии, простейшие, грибы), водоросли, сосудистые растения, не имеющие древесных тканей, черви, медузы. 1