Несколько причин, по которым некоторые минералы могут терять прозрачность при определённых условиях:

• Наличие многочисленных включений или дефектов. 3 Например, молочный кварц теряет прозрачность из-за таких включений. 3
• Агрегатное строение минерального вещества. 1 Минеральные тела, состоящие не из одного индивида, а из многих зёрен, часто кажутся непрозрачными из-за внутреннего рассеяния и отражения света. 1
• Воздействие света. 4 Например, вивианит теряет прозрачность и приобретает тёмно-синий, а затем синевато-чёрный цвет в результате окисления на свету. 4

Также на степень прозрачности влияют характер поверхности кристаллов и кристаллическая структура минерала: непрозрачны большинство минералов, в кристаллической структуре которых доминирует металлическая связь. 12