Несколько причин, по которым некоторые клонированные животные рождаются с признаками донора, а другие имеют фенотипические отличия:

• Случайные эпигенетические изменения. 1 Например, при формировании эмбриона случайным образом инактивируется Х-хромосома, что создаёт уникальную мозаичную структуру клеток и делает клона непохожим на донора, хотя генетически они идентичны. 1
• Разные аллели донорских генов. 3 В разных клетках одного и того же организма набор генов не всегда одинаков из-за мутаций. 3 В результате при клонировании будущий эмбрион получает то один набор аллелей донорских генов, то иной, и клонированные потомки оказываются носителями разных аллелей, что приводит к фенотипическим различиям. 3
• Влияние условий окружающей среды. 13 На фенотип развивающегося эмбриона и растущего потомка влияют разные параметры и состояние внешней среды, характер питания, суточный режим, физическая нагрузка и другие факторы. 3