Некоторые гены могут проявлять неполное доминирование в определённых условиях по нескольким причинам:

• Ни один из двух аллелей не является полностью доминирующим над другим. 1 Это приводит к фенотипу, который отличается как от доминантного, так и от рецессивного аллелей и представляет собой смесь того и другого. 1
• Доминантный аллель не полностью доминирует над рецессивным аллелем. 1 Например, на молекулярном уровне неполное доминирование может возникать из-за двукратного снижения активности фермента или другого белка (если доминантный аллель даёт функциональный белок, а рецессивный — дефектный). 2

Например, за белую окраску может отвечать дефектный аллель, который даёт неактивный фермент, а за красную — нормальный аллель, который даёт фермент, производящий красный пигмент. 2 При половинной активности этого фермента у гетерозигот количество красного пигмента снижается вдвое, и окраска розовая. 2