Нельзя однозначно ответить на вопрос, почему в некоторых фразеологизмах используется «спустя», а не «через».
Однако есть информация, что в значении «по прошествии какого-либо времени» предлоги «через» и «спустя» равнозначны. 3
Некоторые пользователи языка отмечают, что есть стилистическая разница между этими предлогами: «через» чаще используется в разговорной речи, а «спустя» — более книжный вариант. 1 Также есть мнение, что смысловое ударение в случае «через» делается на действии, а «спустя» — на сроке. 1
Например, «через три дня он приехал» и «спустя три дня он приехал». 1