Некоторые бактерии могут обходиться без кислорода в процессе дыхания, потому что они используют другие соединения в качестве конечных акцепторов электронов. 4

Например, при серном дыхании перенос электронов происходит от донора к молекуле элементарной серы с выделением сероводорода и получением энергии. 4 При сульфатном дыхании конечным акцептором электронов являются соли серной кислоты — сульфаты. 4 В случае нитратного дыхания в качестве конечного акцептора электронов выступают соли азотной кислоты — нитраты. 4

Также существуют серобактерии, азотобактерии и железобактерии, которые для дыхания используют окисление соединений серы, азота и железа соответственно. 3

Для аэробных микроорганизмов, напротив, кислород необходим для роста, развития и размножения. 2