Некоторые бактерии могут быть ошибочно отнесены к грамположительным или грамотрицательным по нескольким причинам:

• Существуют грамвариабельные бактерии, которые не могут быть отнесены ни к грамположительным, ни к грамотрицательным организмам. 1 В таких образцах видна смесь розовых и фиолетовых клеток. 1 Например, представители рода гарднерелла имеют необычную грамположительную структуру клеточной стенки, которая заставляет бактерии этого рода окрашиваться как грамотрицательные или грамвариабельные. 1
• Некоторые роды могут быть ошибочно отнесены к другому классу. 1 Например, актиномицеты имеют клеточные стенки, особенно чувствительные к разрушению во время клеточного деления, что приводит к грамотрицательному окрашиванию этих грамположительных клеток. 1 А в культурах бацилл уменьшение толщины пептидогликана в процессе роста ведёт к окрашиванию их грамотрицательно. 1
• Возраст культуры и предварительная обработка антибиотиками могут влиять на результаты окрашивания. 1 Молодые культуры грамположительных бактерий часто содержат недостаточно развитый слой пептидогликана, что может привести к ложноотрицательным результатам. 3

Классификация бактерий по Граму является условной и может относиться к разным аспектам (результат окрашивания, организация клеточных покровов, таксономическая группа), которые необязательно совпадают для всех видов бактерий. 2