Некоторые аминокислоты считаются «разрушителями» α-спиралей, потому что их присутствие в полипептидной цепи препятствует образованию этой структуры. 35

Пролин разрывает или перегибает спираль. 1 Это происходит из-за того, что он не может отдавать амидную водородную связь (не имея амидного водорода), а также из-за того, что его боковая цепь стерически взаимодействует с остовом предыдущего витка — внутри спирали это вызывает изгиб оси спирали примерно на 30°. 1

Глицин также имеет тенденцию разрушать спирали. 1 Это связано с его высокой конформационной гибкостью, которая делает использование относительно ограниченной α-спиральной структуры энтропийно дорогостоящим. 1

Кроме того, близкое расположение аминокислот с одинаково заряженными боковыми радикалами вызывает их отталкивание, что также препятствует образованию α-спирали. 3