Не все пыльцевые зёрна способны прорасти и образовать семена, потому что у некоторых растений есть механизмы самонесовместимости. 1 Они не допускают самооплодотворения для повышения генетического разнообразия в потомстве. 1

Различают два типа самонесовместимости: 1

1. Гаметофитная. 1 Определяется генотипом пыльцевого зерна. 1 Гаплоидное пыльцевое зерно содержит только один аллель гена S, диплоидные же клетки пестика — два. 1 Если аллель пыльцевого зерна совпадает с одним из двух аллелей пестика, то прорастания и оплодотворения не происходит. 1
2. Спорофитная. 1 За неё отвечает серия аллелей одного гена. 1 Она проявляется разным строением цветков одного растения либо различными взаимодействиями между аллелями, предотвращающими самооплодотворение. 1

Кроме того, у ветроопыляемых растений пыльца частично уносится ветром мимо цветков, прибивается дождём, и только небольшое её количество попадает в цель. 4