Наречное выражение «вместе с тем» не обособляется запятыми, потому что не является вводным оборотом. 1
Его даже называют «лжевводным» сочетанием, потому что многие путают его с вводным словом, которое хочется выделить с двух сторон знаками. 4
Чаще всего «вместе с тем» выступает в предложении в значении союзов «однако», «но», «тем не менее» (обозначение противопоставления и уступки). 24