Словосочетание «вместе с тем» часто воспринимается как вводное слово из-за специфики интонационного оформления и синтаксической функции этой конструкции. 1

В некоторых контекстах «вместе с тем» обособляется, что может вводить в заблуждение, так как интонационно его можно выделить. 45

Однако на самом деле «вместе с тем» не является вводным оборотом, а относится к наречным выражениям и не обособляется запятыми. 24