Напряжение электрического поля при электрофорезе должно быть низким для крупных молекул ДНК, потому что чем меньше напряжённость поля, тем более эффективно можно разделить длинные молекулы ДНК с большей молекулярной массой. 12

Это связано с тем, что агарозный гель, который используется в процессе электрофореза, является вязкой средой и препятствует продвижению макромолекул, поэтому короткие фрагменты ДНК движутся к аноду быстрее, чем длинные. 15

Однако слишком низкое напряжение может привести к расширению полосы для небольших фрагментов ДНК из-за диспергирования и диффузии. 4