Молекулярная биология изменила представления о классификации живых организмов по нескольким причинам:

• Появилась возможность изучать тонкие детали строения клеток. 1 Это показало, что клетки разных живых организмов не так одинаковы, как считалось раньше. 1 Особенности строения клеток стали рассматриваться как важный признак, характеризующий большие группы живых организмов. 1
• Молекулярные биологи научились определять последовательность аминокислот в белках и нуклеотидов в нуклеиновых кислотах. 1 Это умение стали использовать в систематике. 1 Сравнивая аминокислотные и нуклеотидные последовательности двух видов, можно сказать, насколько давно жил их последний общий предок. 1 Если провести такое сравнение для нескольких видов, то можно построить эволюционное дерево для целой группы. 1
• Выявилось скрытое биоразнообразие. 2 Морфологически сходные организмы стали демонстрировать значительную молекулярную дивергенцию, и наоборот. 2

Результаты исследований молекулярных генетиков привели к мысли, что границы между видами во многом условны и существуют лишь для удобства человека. 4