Некоторые научные работы о Нефертити вызывали критику среди египтологов, потому что выдвигались разные версии о происхождении царицы, каждая из которых недостаточно подтверждена источниками. 14

Например, существовали разногласия по поводу того, была ли Нефертити египтянкой или иноземной принцессой. 1 Также критиковали гипотезу, согласно которой мумия KV35YL может принадлежать Нефертити. 1 Египтологи, включая доктора Захи Хавасса, подвергли резкой критике версию Джоан Флетчер и объявили найденный возле мумии парик «подброшенной фальшивкой». 1

Кроме того, вызывал критику способ представления облика Нефертити, например, создание обнажённой бронзовой статуи, которую представляли как «модель физической красоты царицы». 2 Египетская служба древностей во главе с доктором Захи Хавассом заявила протест, посчитав такое изображение оскорблением египетской царицы, а обращение с уникальным древним бюстом — варварством, граничащим с вандализмом. 2