Несколько причин, по которым в клетках дизентерийных амёб и лямблий отсутствуют митохондрии:

• Анаэробная среда в кишечнике. 12 Митохондрии производят АТФ только в присутствии кислорода, а в кишечнике его нет. 2
• Утрата неиспользуемых структур. 1 При переходе к паразитизму организмы утратили митохондрии как не нужную структуру. 1
• Минимальные затраты энергии вне организма хозяина. 1 В этот момент простейшие обычно находятся в форме цисты, и затраты энергии минимальны. 1

Также считается, что изначально митохондрии у метамонад были, но потом они их утратили в процессе эволюции. 4