Несколько причин, по которым митохондриальная ДНК в волосах сохраняется лучше ядерной:

• ДНК в стержнях волос медленнее подвергается «посмертному мутированию». 1 Мёртвые кератинизированные клетки защищают сохранившуюся в толще волоса ДНК от разнообразных повреждающих воздействий, в том числе от воды. 1
• В стержнях волос повышена доля митохондриальной ДНК по отношению к ядерной. 1 Это облегчает работу по прочтению именно митохондриальных геномов. 1
• Митохондриальная ДНК из стержней волос меньше загрязнена чужеродным генетическим материалом — бактериальным, человеческим и т. д.. 1

При этом в выпавших волосах без корня ядерная ДНК присутствует в большом количестве по сравнению с митохондриальной, даже в самых дистальных участках стержня волоса. 2 Ядерная ДНК составляет как минимум 88% от общего числа расшифровок генома человека в любом конкретном образце, а обычно — и более 95%. 2