Минорные нуклеозиды важны для стабильности двойной спирали ДНК, потому что они препятствуют спирализации молекулы, так как не имеют комплементарных оснований. 4

Обычно двойная спираль ДНК образуется за счёт взаимодействия между комплементарными азотистыми основаниями, которые образуют водородные связи. 1 Между аденином и тимином могут возникать две такие связи, а между гуанином и цитозином — три. 1

Минорные нуклеозиды, такие как дигидроуридин, псевдоуридин, диметиладенин и диметилгуанин, не могут участвовать в этих взаимодействиях. 5 Их присутствие в молекуле РНК, где их много, влияет на структуру: уменьшается сила гидрофобного взаимодействия в комплементарной паре А-У, что снижает вероятность образования устойчивых двухцепочечных молекул. 5