Миксины считаются одними из самых древних позвоночных животных на Земле, потому что они возникли ещё в кембрийском периоде, то есть около полумиллиарда лет назад. 5

Учёные установили, что древние миксины уже существовали на Земле более 350 млн лет назад. 3 При этом у них уже отсутствовали зачатки позвоночника, но были хорошо развиты органы зрения. 3

Также генетические исследования показали, что у предков современных миксин имелись зачатки позвоночника, которые были представлены недоразвитыми хрящевыми элементами, как у миног, которые считаются ближайшими родственниками миксин. 3 В какой-то момент миксина потеряла позвоночник, так как в нём не было необходимости. 1 Очевидно, произошло это очень давно. 1