Микроскопические окаменелости конодонтов важны для геологического картирования по нескольким причинам:

• Возможность составления стратиграфической шкалы. 1 В слоях разного возраста встречаются разные конодонты. 1 Это позволяет составлять шкалу слоёв земли для определённой территории. 1 Также по конодонтам можно сравнивать последовательность геологических слоёв с широкой территории, прослеживать слой определённого возраста в пространстве. 1
• Использование в биостратиграфии. 12 Поскольку в осадочных породах конодонты очень многочисленны, а их форма быстро менялась в ходе эволюции, их удобно применять для расчленения осадочных пород и сопоставления слоёв в разных регионах. 2
• Помощь в поисках нефти. 12 Конодонты состоят из гидроксиапатита, который способен менять цвет в зависимости от температуры, в которой он находится. 1 Геологи по цвету конодонтов определяют температуру формирования породы и принимают решение, есть ли смысл искать нефть в этих породах или нет. 1