Метод сравнения дочерей с их матерями считается менее точным для оценки быков-производителей по нескольким причинам:

• Невозможность соблюдения сходных условий кормления и содержания. 1 Сравнение справедливо только в том случае, если животные выращивались и продуцировали в сходных условиях. 1 В большинстве случаев это условие невозможно. 1 Поэтому разница в продуктивности дочерей и их матерей в большей степени свидетельствует о различиях хозяйственных условий, а не о генотипе проверяемого производителя. 1
• Игнорирование качества спариваемого маточного поголовья. 2 Результаты оценки производителя зависят не только от его наследственности, но и от качества спариваемых с ним самок. 2
• Необходимость вводить поправки на возраст. 2 Нельзя сравнивать продуктивность потомства, полученную в одном возрасте, с продуктивностью матерей или всего стада, полученной в другом возрасте. 2
• Учёт только лучшей части потомства. 2 Исключение из учёта худшей части потомства, а также случаев рождения мёртворождённых может привести к ложным выводам и переоценке производителя. 2