Лопатоносы считаются редкими рыбами, потому что из-за вмешательства человека происходит уничтожение их естественных сред обитания — гравийных и медленно текущих участков реки. 1

Например, исторический ареал амударьинского большого лопатоноса — Амударья и её притоки. 3 После строительства гидросооружений, перекрывших свободное перемещение по руслу, область обитания рыбы значительно сократилась. 3

Некоторые виды лопатоносов находятся под угрозой исчезновения: так, белый лопатонос (эндемик рек Миссури и Миссисипи) в 2022 году был признан «находящимся на грани полного исчезновения». 12