Локусы генов различаются по длине и расположению на хромосомах по нескольким причинам:

• Вариации размеров и числа интронов. 1 Они длиннее экзонов и могут варьировать по размерам, числу и последовательностям. 1 Например, интроны длиннее экзонов в 2000 раз и более. 1
• Наличие генных тандемов. 1 Они располагаются на разных хромосомах, и их длина может варьировать в пределах вида. 1
• Вариации числа копий генов. 5 Они являются результатом инсерций, делеций и дупликаций больших сегментов ДНК, которые включают гены. 5

Расположение генов на хромосоме также отличается: члены генного семейства обычно находятся на одной хромосоме рядом друг с другом, но в некоторых случаях функциональные или нефункциональные члены семейства могут находиться на другой хромосоме. 5