Линия Уоллеса считается важной природной границей между двумя флористическими регионами, потому что она отражает резкие различия в флоре и фауне двух регионов. 2

Это обусловлено историческими причинами — древним отделением материков и эволюционным развитием разных видов в изоляции друг от друга. 2 Флора и фауна островов по разные стороны от линии Уоллеса развивалась в условиях длительной географической изоляции. 3 Океан между материками (и островами) стал непреодолимой преградой для животных и растений, нарушив поток генов. 3 В изолированных популяциях накапливались и закреплялись естественные специфические мутации. 3 При накоплении различий возникла репродуктивная изоляция и сформировались новые виды (географическое видообразование). 3

Кроме того, линия Уоллеса стала фундаментальным понятием в теории эволюции, подтверждая, что географическая изоляция может привести к значительным различиям в эволюции видов. 4