Латинский квадрат используется в криптографии благодаря своим свойствам, которые обеспечивают высокий уровень криптостойкости. 1
В таких квадратах символы не должны повторяться в каждой строке и в каждом столбце, что делает зашифрованное сообщение не поддающимся частотному анализу. 34 Кроме того, зашифрованное сообщение получается путём двукратного шифрования с различными ключевыми последовательностями, что создаёт сложность при расшифровке сообщения. 1
Впервые латинский квадрат был применён в шифре Тритемия для многоалфавитного шифрования: первая буква открытого текста шифруется первым алфавитом (первой строкой таблицы), вторая — вторым и так далее. 2
Ещё один пример использования латинских квадратов в криптографии — шифр Edon80, предложенный в 2005 году. 1 Создатели этого шифра из 576 существующих латинских квадратов 4-го порядка тщательно выбрали 4, на основе которых в криптографии строится конвейер из 80 латинских квадратов для выработки гаммы. 1