Кроссинговер влияет на изменение признаков у гибридных растений, потому что он способствует смешению и рекомбинации генов. 3 Это увеличивает вероятность появления новых полезных комбинаций генетической информации, способных улучшить биологические характеристики организма. 3

Например, при скрещивании отдалённых форм кроссинговер может разделить очень тесно сцепленные участки, в результате чего возникает совершенно новое сочетание с «мутантным» фенотипическим проявлением. 2

Также благодаря кроссинговеру разные пары признаков, гены которых находятся в негомологичных хромосомах, наследуются независимо друг от друга, в результате чего у гибридов возникают новые комбинации признаков, отсутствующие у родительских форм. 1