Кроссинговер важен в генетических исследованиях, потому что он:

• Увеличивает комбинативную изменчивость. 24 Это приводит к разнообразию гамет и, как следствие, генетическому разнообразию потомства. 4 Это обеспечивает эффективность действия естественного отбора и возникновение большего разнообразия приспособлений к условиям окружающей среды. 4
• Позволяет создавать новые, ранее не существовавшие комбинации генов. 1 Это повышает наследственную изменчивость, которая даёт широкие возможности адаптации организма в различных условиях среды. 1
• Помогает составлять генетические карты хромосом. 23 На основе частот кроссинговера можно судить о взаимном расположении генов и расстоянии между ними, то есть картировать гены. 5