Компартментализация трансляции характерна только для эукариотических клеток, потому что механизмы инициации трансляции у про- и эукариот существенно отличаются. 1

Прокариотические рибосомы способны находить стартовый AUG и инициировать синтез на любых участках мРНК, в то время как эукариотические рибосомы обычно присоединяются к мРНК в области кэпа и сканируют её в поисках стартового кодона. 1

Кроме того, в эукариотических клетках часть рибосом связана с мембраной эндоплазматической сети, в них синтезируются в основном белки, которые поступают затем в аппарат Гольджи и выводятся (секретируются) из клетки. 5